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中国科学院西北高原所发表藏羚首个染色体水平的高质量基因组（图）
染色体 基因 遗传
2024/11/14
藏羚（Pantholops hodgsonii）是世居青藏高原的典型反刍动物，平均分布海拔3,250-5,500 m，属鲸偶蹄目（Cetartiodactyla），牛科（Bovidae），藏羚属（Pantholops），是藏羚属唯一物种。19世纪中期至20世纪初，猖獗的非法盗猎使藏羚的种群数量下降了约90%，2000年被IUCN红色濒危物种名录评估为濒危物种。经过30多年的保护，藏羚的种群数量恢复...
中国科学院广州分院华南植物园发布粗叶榕染色体水平基因组（图）
植物 染色体 基因
2024/11/25
粗叶榕（Ficus hirta Vahl）又称五指毛桃，为桑科榕属的药食同源植物，是一种具有重要经济价值的植物。其根部为浅黄色，有香气，富含多种生物活性化合物，如黄酮类、苯丙素类和多糖等，这些成分在植物的抗病能力、适应环境变化以及药用价值上都扮演着关键角色。目前，对粗叶榕的基因组研究仍然相对较少，尤其是在其特定药用成分的生物合成途径方面。尽管已有部分关于粗叶榕基因组的初步研究报告，但这...
中国科学院海洋所发表中肋骨条藻高质量染色体水平参考基因组（图）
基因 生态系统 水产养殖
2024/11/8
2024年1月1日，藻类学期刊Algal Research刊发海洋所在硅藻基因组学研究方面的最新成果。该研究成功构建了中肋骨条藻（Skeletonema costatum）高质量染色体水平参考基因组，这是在成功构建海洋优势浮游植物玛氏骨条藻（Skeletonema marinoi）和热带骨条藻（Skeletonema tropicum）染色体水平基因组后完成的第三个骨条藻属物种的参考基因组。
中国科大在评估染色体外环状DNA检测方法取得进展（图）
评估 染色体 检测
2024/12/4
2024年10月25日，中国科学技术大学生命科学与医学部瞿昆教授课题组在《自然·通讯》期刊上发表了文章“Comparative analysis of methodologies for detecting extrachromosomal circular DNA”，系统性评估了7种在测序数据中鉴定eccDNA的分析算法及7种不同实验建库方法的性能和差异。
研究揭示染色质结构和折叠机制
染色质结构 真核生物 基因
2024/8/21
中国科学院生物物理研究所朱平研究组和李国红研究组合作，揭示了连接组蛋白H5介导的核小体结合和染色质折叠和高级结构形成机制。相关论文近期发表于《细胞研究》。
中国科学院研究揭示连接组蛋白H5介导的核小体结合与染色质折叠和高级结构形成机制（图）
蛋白 结构 细胞
2024/8/21
2024年8月5日，中国科学院生物物理研究所朱平研究组和李国红研究组，在《细胞研究》（Cell Research）上在线发表了题为Structural basis for linker histone H5–nucleosome binding and chromatin fiber compaction的研究论文。该研究获得了由连接组蛋白H5折叠十二个核小体形成的染色质颗粒3.6埃分辨率的冷冻电...
中国科学院水生所揭示鲇属鱼类性染色体早期演化历程（图）
染色体 基因 水生生物
2024/8/19
性别是真核生物的共源性状，也是生命演化的主要驱动力。多数脊椎动物的性别受性染色体调控，而性染色体通常由常染色体获得性别决定基因而起源。独立的起源和性染色体的转换致使性染色体呈现出高度的多样性和易变性。模式哺乳动物中的X和Y性染色体以及鸟类中的Z和W性染色体解析得较为透彻，但这些异形染色体拥有久远的演化历史，很难追溯性染色体早期阶段演化过程。因此，在一些非模式鱼类中，形成时间较晚的同形性染色体为阐明...
2024年8月8日，《植物·通讯（Plant Communications）》在线发表了中国农业科学院深圳农业基因组研究所（岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心）潘玮华团队联合中国科学技术大学徐云教授课题组、海南大学陈飞教授团队的研究论文，题为 “CentIER: accurate centromere identification for plant genome”。该研究开发了一个着丝...
国家自然科学基金委员会中国学者在植物异染色质染色中心形成研究领域取得新进展（图）
植物 染色质 细胞
2024/8/25
在国家自然科学基金项目（批准号：32070651、31822028 、91940306）等资助下，清华大学孙前文团队揭示了植物异染色质染色中心形成的分子及进化机制。相关研究成果以“进化的异染色质凝聚可调控植物中染色中心的形成和转座子沉默（Evolutional heterochromatin condensation delineates chromocenter formation and re...
染色体重排可以通过改变三维染色质结构，进而影响基因的表达调控，从而导致物种性状的多样化和适应进化。在脊椎动物中，几乎没有染色体间3D染色质相互作用，包括拓扑关联域（TADs）、subTADs和loop环。此前研究者对麂子（一种具有密集染色体融合的哺乳动物群体）的研究表明，通常哺乳动物之间不同的3D染色质结构是保守的，但染色体重排会导致断点区域周围的更多3D染色质改变，并且可能在麂子的演化和适应中产...
鲨鱼的XY性染色体起源于1.8亿年前（图）
鲨鱼 XY性染色体 脊椎动物
2024/8/22
西南大学生命科学学院教授徐洛浩团队重构了软骨鱼类及有颌脊椎动物的染色体演化历史，获取了首个软骨鱼类高质量Y染色体序列，发现鲨鱼的XY性染色体起源于其共同祖先，距今1.8亿年前。2024年7月11日，相关研究成果发表在《细胞基因组学》上。
复活猛犸象不是梦！科学家重建猛犸象三维染色体
猛犸象 三维染色体 细胞
2024/8/22
一个国际研究小组成功地重构了一只生活在5.2万年前的猛犸象的基因组和三维染色体结构，这是首次利用古代DNA样本开展此类研究。研究揭示了猛犸象基因组在细胞内的组织方式，以及特定基因在其皮肤组织中的表达情况。相关研究7月11日发表于《细胞》。
中国科学院遗传发育所绘制冬小麦春化建立、维持和重置过程中的转录及染色质动态图谱（图）
遗传发育 过程 植物
2024/7/18
春化是指植物需要经历长时间的低温处理才能开花的现象，能够保证越冬植物在合适的光温条件下进行生殖生长，从而确保产量。小麦根据春化的需求分为需要经历春化才能开花的冬性小麦和不需要经历春化便能开花的春性小麦。研究小麦春化以及春化调控机制，对提高小麦品种的适应性具有重要意义。
春化是指植物需要经历长时间的低温处理才能开花的现象，能够保证越冬植物在合适的光温条件下进行生殖生长，从而确保产量。小麦根据春化的需求主要分为需要经历春化才能开花的冬性小麦和不需要经历春化就能开花的春性小麦。对小麦春化进行研究，了解春化调控的机制，对提高小麦品种的适应性具有广泛意义。
中国科学院科学家揭示脊椎动物中旁着丝粒异染色质从头建立机制（图）
脊椎动物 蛋白 遗传
2024/7/19
2024年7月4日，中国科学院生物物理研究所朱冰研究组在《自然》（Nature）上发表了题为Targeting pericentric non-consecutive motifs for heterochromatin initiation的研究论文。该研究揭示了脊椎动物中旁着丝粒异染色质的从头建立机制。