搜索结果: 1-6 共查到“分子遗传学 EST”相关记录6条 . 查询时间(0.078 秒)
植物EST计划作为植物基因组计划的一个重要组成部分,本文概括介绍了几种主要EST标记(EST-SSR, EST-PCR, EST-SNP, EST-AFLP, EST-RFLP)在比较基因组学,系统发育学,基因功能研究等方面的应用情况,并对EST标记的应用前景作了展望。
借助斑马鱼EST数据库从鲤鱼微卫星序列中寻找蛋白编码基因(英文)
鲤鱼 in silico 微卫星标记 Blast
2009/6/23
应用 in silico的方法,利用Blastn 和Blastx 搜索引擎,将鲤鱼微卫星序列与GenBank数据库进行同源序列比对。利用Blastn,将侧翼序列长度>50 bp的875个鲤鱼微卫星序列与斑马鱼的EST数据库首先进行比对,结果找到了121个同源序列。随后采用Blastx搜索蛋白质数据库,有94个微卫星位点存在同源蛋白。除了33个假定和3个未知蛋白外,剩余的58个微卫星位点被成功地进行...
Multiple banding pattern,a potential problem of cross—species microsatellite amplilification,happened when EST-SSR
primers of Porphyra yezoensis were used in microsatellite amplification for several ...
植物基因组表达序列标签(EST)计划研究进展
植物基因组 表达序列标签 生物信息学
2008/6/6
植物表达序列标签(EST)计划是随机挑选cDNA克隆,并对其3′或5′端进行大规模一次性测序,将得到的150~500 bp长度的DNA片段与数据库中的序列进行比较,获得对基因组结构、组织、表达等认识的基因组研究策略.就近年来国际植物EST计划的实施情况、植物EST计划的研究范围、生物信息学在EST研究中的应用、EST数据库及查询、植物EST研究中遇到的问题等方面内容进行了综述.
柑橘EST-SSR分子标记分析
柑橘 EST 微卫星 SSR
2008/2/8
摘要对来源于甜橙(CitrussinensisOsbeck)、枳壳(PoncirustrifoliataRaf.)和其他柑橘非冗余EST数据库的38124条单一基因(Unigene)序列进行了简单重复序列SSRs(SimpleSequenceRepeat)搜索,所分析的柑橘非冗余核酸序列总长23.29Mb,从中获得了8218条SSR,其中包括单碱基重复4913条(59.8%),2碱基重复1419条...
摘要采用Genomic-SSR和EST-SSR标记技术,对来自我国北方冬麦区的18份普通小麦品种(系)的遗传多样性进行了探讨,并与系谱遗传距离进行了比较分析。研究发现,平均每个Genomic-SSR检测到的等位基因数为3.34个,明显高于EST-SSR的2.31个。遗传距离(GD)计算结果显示,18个小麦基因型之间的EST-SSR平均遗传距离较小,仅为0.3996,低于Genomic-SSR的GD...