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甘薯小象甲是国内外重要检疫性害虫，明确中国不同地区甘薯小象甲的遗传多样性可为甘薯小象甲的鉴别检疫提供依据。本文通过对中国6个地区甘薯小象甲种群rDNA ITS-1序列的遗传变异分析探讨了中国6个地区种群的入侵来源。结合世界其他地区已公布35个甘薯小象甲种群序列，经系统发育分析表明，甘薯小象甲起源于印度次大陆，在亚洲地区随甘薯的调运而自东南向西北扩展，构建的系统发育树分为印度地区分支和亚洲东部分支两...
为给小麦孢囊线虫综合治理提供一定的理论依据，通过对苏皖鲁豫接壤地区30块田的调查和分析，探讨了这些地区麦田小麦孢囊线虫的发生情况及线虫群体之间亲缘关系。结果表明，采集的30份样品中都能检测到孢囊线虫，孢囊密度为每100 g土壤1~80个。进一步对30个小麦孢囊线虫群体的rDNAITS区PCR扩增、测序，对其序列进行比较分析发现，30个分离物的核苷酸序列同源性为97.1%～100%，与已报道的中国...
rDNA-ITS序列鉴定深部真菌菌种的研究进展
ITS区 鉴定 深部真菌
2012/8/9
目前深部真菌病的发生率呈逐渐上升趋势,有关深部真菌菌种的鉴定成为研究热点。由于传统的菌种鉴定方法存在费时及易受实验条件影响等不足,核糖体rDNA-ITS序列分析法已越来越广泛的应用于真菌属内不同种间的系统发育研究中。本文综述了核糖体rDNA-ITS鉴定深部真菌菌种的研究进展,展望了其应用前景。
金黄壳囊孢菌 rDNA ITS序列测定及生理学特性
金黄壳囊孢菌 培养特性 rDNA ITS序列 物候期
2011/8/17
通过在实验室内培养杨树烂皮病菌金黄壳囊孢菌菌株CC1,确定了其孢子萌发有一定的物候期,产孢规律与自然条件下杨树烂皮病的发病季节一致,其菌丝生长不随季节的变化而变化。菌株CC1的生长最适温度30℃,最适pH值为5～6,最适碳氮源分别是葡萄糖和蛋白胨。最适培养基配方:马铃薯200 g,蔗糖20 g,酵母膏2 g,蛋白胨2 g,硫酸镁0.5 g,磷酸二 氢钾1.5 g,维生素B1 100 mg,琼...
不同来源白首乌rDNA ITS序列分析
白首乌 克隆 ITS序列 序列分析
2012/8/16
研究白首乌不同种的ITS序列遗传差异性,分析序列差异性在白首乌品种鉴定及种质资源研究中的意义。 方法: 从不同来源的白首乌中提取总DNA, 以核基因组ITS通用引物进行扩增,扩增产物经克隆后,进行测序。 结果: 获得4个不同来源样品的ITS全序列及5.8S全序列以及两端的18S,26S的部分序列,其中戟叶牛皮消Cynanchum bungei ITS序列为国际首次获得,登录号分别分别为GU1989...
中国不同地区蛇床的rDNA ITS序列分析
蛇床 rDNA内转录间隔区 纬度
2010/1/12
目的：探讨不同分布区的蛇床Cnidium monnieri的ITS序列变异与其地理分布和化学成分的相关性。方法：设计2对引物，Pf+Pb及P5.8S ITS1+P5.8S ITS2，PCR扩增产物纯化后用银染法或ABI 310测序。结果：得到核糖体DNA中的ITS及5.8S rDNA完全序列，18S和26S rDNA部分序列,共约700 bp。5个地点样品的ITS-1及ITS-2的序列大小分别为2...
甘肃野生秦艽rDNA ITS区序列分析
甘肃 秦艽 ITS序列
2012/8/6
比较研究甘肃不同地区4种野生秦艽rDNA ITS碱基序列的差异及其规律,寻找秦艽组药材之间的分子鉴别方法。 方法: 对rDNA ITS区进行了PCR扩增、测序,运用Clustal X,MEGA3等软件对ITS区序列进行分析。 结果: 不同地区秦艽、麻花秦艽、小秦艽及黄管秦艽的ITS长度为800 bp,ITS1,5.8S和ITS2序列长度分别为290,170,340 bp。根据两者序列以邻接法建立分...
斯氏副柔线虫rDNA-ITS片段的克隆及序列分析
斯氏副柔线虫 rDNA-ITS片段 克隆
2009/6/11
运用PCR方法以保守引物NC5、NC13、NC13r和NC2扩增从内蒙古地区骆驼皱胃分离的3条斯氏副柔线虫（Parabronema skrjabini）rDNA的内转录间隔区1（ITS1）、5.8S序列和内转录间隔区2（ITS2）。将PCR扩增出的片段纯化后克隆至pGMT载体，用PCR技术及酶切鉴定阳性菌落，对阳性菌落质粒DNA进行测序。结果表明线虫1（P.sk1）扩增的ITS片段大小为837 ...
运用PCR方法以保守引物NC5、NC13、NC13r和NC2扩增从内蒙古地区骆驼皱胃分离的3条斯氏副柔线虫（Parabronema skrjabini）rDNA的内转录间隔区1（ITS1）、5.8S序列和内转录间隔区2（ITS2）。将PCR扩增出的片段纯化后克隆至pGMT载体，用PCR技术及酶切鉴定阳性菌落，对阳性菌落质粒DNA进行测序。结果表明线虫1（P.sk1）扩增的ITS片段大小为837 ...
对金耳( Tremella aurantialba) 的担子果、酵母状分生孢子培养物和菌丝培养物的核糖体DNA 内部转录间隔区( ITS) 序列进行PCR 扩增和测序。结果表明金耳担子果的ITS 区PCR 产物均为碱基数不同的两条带, 片段长度和序列与酵母状分生孢子培养物、菌丝培养物一致。通过对ITS1 和ITS2 联合进行系统发育分析表明金耳酵母状分生孢子培养物归属于银耳属的金耳, 参与组成...
采用真菌核糖体基因转录间隔区(ITS)用引物，PCR分别扩增了Phytophthora sojae的5个菌株(Pg1、Pg2、Pg3、CN1和S317)和1个P. medicaginis(菌株44390)的ITS1与ITS2，并对PCR产物进行了序列测定。根据Bioedit软件中的neighbour-joining methods分析法将上述序列和Genbank中已登录的P. sojae、P. m...
镰刀菌rDNA ITS序列的克隆及序列分析
镰刀菌 rDNA 序列分析 同源性
2009/1/5
本试验以PMD18-T为载体，对10个镰刀菌菌株的rDNA的ITS区及28S部分片段进行了克隆、测序，用DNAMAN4.0软件进行序列分析，分析了菌株间的同源性及遗传距离，并建立了分子系统进化树。试验结果表明：所测各菌种间的亲缘关系在92.2%～99.9%之间，反映了种间较大的遗传差异，这与形态学上把它们鉴定为不同的种相吻合，而从不同地区，不同寄主上分离的同一菌种的不同专化型，其同源性高达96.6...
珠母贝属(Pinctada)的一些种类是生产海水珍珠的重要母贝, 个别种类已濒临灭绝。本文利用核糖体DNA内部转录间隔区1(ITS1)和2(ITS2)序列对珠母贝属常见种类的系统发育和分类地位进行了分析。结果表明: ITS1长410–482 bp, 其中Pinctada maxima最长, P. fucata, P. fucata martensii, P. imbricata和P. nigra最...
内蒙古中东部草原羽茅Epichlo属内生真菌的分布及rDNA-ITS序列系统发育
羽茅 内生真菌 系统发育 rDNA-ITS
2007/12/11
摘要 对内蒙古中东部地区分布的羽茅6个地理种群的染菌率进行了调查，采集种子并从中分离得到不同形态型的内生真菌，选取其中的19株进行rDNA-ITS片段的扩增、克隆、测序和系统发育分析。结果表明：（1）6个样地羽茅种群内生真菌感染率除西乌旗为96.7%外，其他5个样地均为100％，表明内生真菌侵染羽茅并非偶然现象，二者之间存在一种稳定的共生关系。（2）ITS和5.8S序列得到的N-J树显示，相对于E...