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Karyotype Analysis of Lablab purpureus (L.) Sweet Using Fluorochrome Banding and Fluorescence in situ Hybridisation with rDNA Probes
combined PI and DAPI staining FISH hyacinth bean karyotyping ribosomal gene
2015/10/9
The mitotic chromosomes of Lablab purpureus (L.) Sweet were characterised using sequential combined propidium iodide (PI) and 4',6-diamidino-2-phenylindole (DAPI) (CPD) staining and fluorescence in si...
普通小麦rDNA的ITS区及其基因组起源
小麦 ITS序列 同步进化
2009/11/2
采用特异引物对普通小麦(Triticum aestivum L.) rDNA的ITS区片段进行PCR扩增并测序，通过邻接法聚类分析, 得到3种类型的扩增产物。结果表明，ITS区序列长度是602 bp，其中ITS1和ITS2分别有8个和20个变异位点，ITS区揭示的遗传分化距离变化范围为0~0.038,平均值为0.021。通过从GenBank搜索并下载普通小麦野生近缘种ITS序列与本研究获得的普通小...
栽培稻种内rDNA基因IGS序列分析及系统学意义
栽培稻 核糖体 基因间区(IGS) 系统树
2009/10/30
以普通野生稻为对照, 将rDNA基因间区(IGS)序列用于栽培稻种内不同亚种以及亚种内不同品种的亲缘关系分析。结果表明, 栽培稻种内IGS序列长度为2 130~2 145 bp, G+C含量为74.59%~75.29%, 变异位点229个, 占10.70%, 信息位点76个, 占3.51%。IGS序列中籼亚种和粳亚种之间有38个亚种标志性碱基差异, 主要分布在IGS 5′ 端近400 bp的序列中...
水稻是宁夏地区主要粮食作物, 水稻种植也具有维持生态系统平衡, 防止土地荒漠化等重要的生态功能。而稻田土壤细菌是维持土壤生态功能的基础。但长期以来缺乏对干旱地区稻田土壤细菌多样性的认识。本研究采用非培养技术提取稻田土壤样品总DNA, 构建其16S rDNA克隆文库, 用PCR-RFLP分析进一步测序后聚类分析细菌群落的多样性。从稻田土样中分离获得了大于23 kb的DNA片段。PCR-RFLP共得到...
具有溶磷能力的相思根瘤菌16S rDNA 序列分析
相思根瘤菌 16SrDNA全序列测定 系统发育学分析
2009/5/19
为了测定具有溶磷能力的相思根瘤菌的16S rDNA 序列。在TY 培养基上将菌株培养至对数生长期, 以提取的总DNA 为模板, 采
用双向引物进行PCR 扩增, 对获得的目的产物进行纯化和测序。采用PHYLIP 软件中DNADIST 程序分析各菌株间的相似性, 采用
Clustal X 和Treeconw 软件获得菌株的系统发育树状图。系统发育学分析表明:G7-3 、G31-1-5 、G31-...
甘蓝2号染色体的高分辨率5S rDNA荧光原位杂交
羽衣甘蓝 5S rDNA 荧光原位杂交
2010/2/5
【目的】羽衣甘蓝5S rDNA 的染色体定位和拷贝数分析,为进一步利用FISH进行2号染色体基因定位和细胞遗传图谱构建奠定基础。【方法】以羽衣甘蓝为材料,采用荧光原位杂交技术将DIG标记的5S rDNA探针定位于不同分辨率的绒毡层细胞中期染色体、粗线期染色体以及伸长DNA纤维上。【结果】在中期染色体和粗线期染色体上,都同时获得3个杂交信号位点（a、b、c）,且位于2号染色体的长臂近着丝粒区域,其信...
中国西藏近缘野生大麦5S rDNA NTS序列分析
西藏野生大麦 5S核糖体DNA 非转录间隔区（NTS）
2008/1/30
摘要选取来自西藏不同地理区域的17份近缘野生大麦材料和1份国外的近缘野生大麦材料，利用直接PCR、T-载体转化克隆、克隆产物测序的方法获得了它们的5S核糖体DNA NTS（Nontranscribed intergenic spacer）序列。对这些序列进行测定、分析和比较，构建了分子系统树。结果表明，西藏近缘野生大麦NTS序列包括两段相对保守的保守区A和保守区B以及一段变异较大的变异区V，变异区...
水稻45S rDNA和5S rDNA的染色体定位研究
水稻 荧光原位杂交 rDNA
2008/1/25
摘要45S rDNA和5S rDNA是水稻中与核糖体RNA合成有关的2个功能片段。有关这2个序列在水稻染色体上的位置,不同研究者的研究结果不尽相同。在获得水稻染色体清晰制片的基础上,通过FISH确定了45S rDNA序列位于水稻的第9号和第10号染色体的短臂末端,并且第9号染色体上的拷贝数多于第10号染色体。5S rDNA序列位于第11号染色体短臂靠近着丝点处。
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波兰小麦和矮兰麦45S rDNA和5S rDNA基因位点FISH分析
波兰小麦 矮兰麦 rDNA基因 荧光原位杂交
2008/1/21
采用双色荧光原位杂交技术, 以45S rDNA和5S rDNA基因为探针, 对波兰小麦(Triticum polonicum L.)和矮兰麦(T. turgidum L. cv. Ailanmai)进行了分析。结果表明, 高秆波兰小麦(T. polonicum L. High)和矮兰麦的45S rDNA和5S rDNA基因位点高度一致, 都显示4个45S rDNA和6个5S rDNA基因位点; 矮...
大豆疫霉根腐病菌的rDNA ITS序列分析
大豆 疫霉根腐病菌 rDNA 系统发育
2007/12/7
摘要采用真菌核糖体基因转录间隔区(ITS)通用引物, PCR扩增了大豆疫霉根腐病菌具有差异的17个菌株的ITSI与ITS2,经过与DL2000的标准分子量DNA进行比较, 得到了大约800~1000 bp左右的片段, 并对PCR产物进行了序列测定。以 USA 为外类群利用最大简约法构建了大豆疫霉根腐病菌的系统发生树, 并分析了菌株之间的遗传进化关系。结果表明: 不同菌株ITS1和ITS2在碱基构成...
Differences Between South American H Haplome Diploids and I Haplome Diploids from the Perspective of the 5S rDNA Gene in the Genus Hordeum
5S DNA gene molecular clock paleopolyploid
2014/3/17
Twelve South American diploid Hordeum species belonging to the H genome and three diploid species
belonging to the I genome (including cultivated barley) were investigated for their 5S rDNA sequence...
数值分类表明 ,分离自西北半干旱地区的 9株黄芪根瘤菌构成一个独立的表观群。在此基础上 ,进行了DNA同源性及 16 S r DNA全序列分析。 9株菌的 G +C mol%在 5 9.1～ 6 0 .3之间 ;群内 DNA同源性为 81.5 %～91.0 % ,大于 70 % ;中心菌株 SH2 90 B与各已知种模式菌株 DNA同源性在 10 .5 %～ 6 3.0 % ,小于 70 %。 S...
数值分类表明 ,分离自西北半干旱地区的 9株黄芪根瘤菌构成一个独立的表观群。在此基础上 ,进行了DNA同源性及 16 S r DNA全序列分析。 9株菌的 G +C mol%在 5 9.1～ 6 0 .3之间 ;群内 DNA同源性为 81.5 %～91.0 % ,大于 70 % ;中心菌株 SH2 90 B与各已知种模式菌株 DNA同源性在 10 .5 %～ 6 3.0 % ,小于 70 %。 S...